日本有86所国立大学，92所公立大学和约600所私立大学。国立大学由公民缴纳的税款资助。公立大学由地方政府（县等）公民缴纳的税款资助。它指的是一所主要由私人资本运营和运营的大学。通常，它是指由非地方或中央政府投资并全部或部分依靠学生学费来维持的大学的运营而不是公共资金的大学，并且大学有权选择自己的来源学生的 。
如果把公立大学国立大学与私立大学作对比，由于公立大学对当地学生有政策优待、学费优惠，毕业后在本地就职也非常顺理成章，因此公立大学中的生源地较为单一，国立大学则聚集着全国各地的学生。日本私立大学与国公立大学侧重性不同，研究性方面因资金问题普遍不如国公立大学，多侧重于社会实践，但也有资金充沛、研究水平高的庆应义塾大学等世界一流私立大学。对于许多日本家庭来说，优先选择国公立而非私立的原因之一即是学费的巨大差异。
教学质量
对比日本的公立大学和私立大学的校园氛围有很大差别，其中的主要原因之一是学生人数。例如，2017年早稻田大学（私立）的学部生约有44000人，庆应大学（私立）有近28000人。而东京大学（国立）只有约14000人左右，与早庆相差2-3倍学生人数。
2017年早稻田大学有546个官方认证的社团，从兴趣类、学术类到各种同好会、NPO，大概有1000个网球社。而东京大学2017年的届出学生团体和体育部有约200+个。庞大的人数是优势也是劣势。
通常大三、大四时文科学生就要进入教授的研究室，理科学生进入教授的研究室，与中国大学的导师制相仿，毕业论文也由相应教授指导。一个教授带3个学生和一个教授带10个学生的体验自然不同。某些私立大学还会出现一个教授同时负责50-100个学生的情况，但国立大学的教授所对应的学生比私立大学少得多。
一般来说，如果学生具备较强的个人素质，想要学习尖端理工科专业，可以首先考虑国公立大学，不但学习费用相对较低，而且政府给予学校充足的经费扶持，很好地释放了学校在经济运转上的压力，让学生可以接触到更先进、前沿的教育资源和科研设备，学术产出得到充分的保障。
私立大学数量之多在最大程度上降低了学生的报考风险，部分学校录取门槛相对较低，选择面较广。但是因为私立大学由个人财团组织创建，政府对其的财政资助较少，经费主要来源于学费收入，学费也均高于国公立大学，希望大家根据自身经济条件做出理性选择。
北京外国语大学日本Pass项目部分合作院校：东京大学、早稻田大学、庆应义塾大学、东京艺术大学、上智大学、同志社大学、京都大学、大阪大学
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