988年，在经历了20多年的争论之后，杜塞尔多夫大学被以德国诗人、作家和政治思想家海因里希·海涅的名字命名，海涅于1797年出生在杜塞尔多夫。 　　

虽然拿破仑在1811年时就打算在杜塞尔多夫建立一个大学，但直到1907年，这里医科学院才与市立医院同时建立。1923年，这个医科学院被认可为大学体制。1935年以后，可以培养博士生。战后，北威州与杜塞尔多夫市签署了一个合同，由州政府接管了对这个医科学院的管理。1965年11月，医科学院改为综合大学，在医学系外，设立了一个文科与理科综合系。1988年，这个大学正式以杜塞尔多夫市最引以为自豪的儿子海涅命名，成为亨利希。海涅杜塞尔多夫大学（Heinrich-Heine-UnivesitaetDuesseldorf）。