基尔大学创办于1665年，历史悠久，学科门类齐全，是德国富有传统的大学之一。一批享有声望的科学家曾在此任教，如马克斯·普兰克（MaxPlanck），海因里希·赫茨（HeinrichHertz），以及于1950年获诺贝尔奖的化学家奥托·迪尔斯（OttoDiels），他是在基尔任教过的总共6名诺贝尔奖获得者中的最后一名。

　　第二次世界大战期间，基尔大学除校属医院之外，几乎所有的大学建筑物都毁于空袭。1945年后，基尔大学在基尔市西北郊一块约80公顷的土地上进行了重建和扩建。只有校属医院还留在市中心附近的原大学旧址上。现在除了少数几个部门外，大学的所有院、系、诊所均被安排在崭新的配有现代化设施的大楼里。

　　院系设置

　　基尔大学共包括九个学院：神学院（Theologie）、法学院（Rechtswissenschaften）、经济--社会科学学院（Wirtschafts- und Sozialwissenschaften）、医学院（Medizin）、人文学院（Philosophie）、数学-自然科学学院（Mathematik-Naturwissenschaft）、农业学院（Agrarwissenschaften）、教育学院（Erziehungswissenschaften）、技术学院（Technik）等九个学院80个专业，其专业领域从考古学、药物学到罗马语直至动物学，此外还为在校学生提供音乐、文化和体育等丰富多彩的课外活动；由于拥有众多的重点研究课题、特殊研究领域、同时有博士授予资格、其研究生院和一群闻名的学院使基尔大学的教学独树一帜。其165个院系、医院及其他机构分别分布在250多栋大楼内；此外，还拥有三个占地面积约500公顷的可耕农田的实验农场；基尔大学的中心图书馆（Zentralbibliothek）和各院系的专业图书馆藏有各类专业图书达550多万册。基尔大学的法律地位和编制是依据石勒苏益格-荷尔斯泰因州的高校法确立的，大学是公法的法人，其最高管理者是校长办公室，由校长、两名副校长和总务长组成；大学最重要的管理机构有大学评议会、监理会和各系务会。

　　研究机构

　　在2001年的英国大学研究水平评估中，基尔大学的法律学院被评为5*，英语学院，应用数学系，历史学院，美国研究学院，政治，国际关系及环境学院，医学科学技术中心被评为5。 此外，一项对社会政策与治理委员会的跨学院提案也被评为5。

　　基尔大学在心理，生物，俄语，音乐，商业和管理研究以及社区临床医学等专业领域都在2001年的英国大学研究水平评估中获得高分。

　　基尔大学的研究生活动由一个研究生进行协调，在以下七个研究机构中组织开展：

　　人文科学研究机构法律，政治和司法研究机构生命课程研究机构公共政策和管理研究机构环境，物理科学及应用数学研究机构 （EPSAM） 医学科学技术研究机构基础护理及健康科学研究机构自2005年起，研究和企业办公室开始管理基尔大学的企业活动。

　　耳蜗移植项目在基尔大学的通信和神经科学学院开展。