不同大学的金融硕士设置的侧重点不同。以圣路易斯华盛顿大学为例，该大学商学院的金融硕士下设2个方向：企业金融和数理金融。在企业金融方向中，学生要在投资银行学、资产管理、金融产品交易与销售、产业金融与金融咨询等方面进行深入学习。而在数理金融方向，学生主要学习信誉风险分析、金融衍生品定价、风险管理模型与金融软件开发。罗切斯特大学的金融硕士设置略有不同，没有特定的方向划分，主要是从银行学、企业金融、风险管理和投资管理4个方向来培养学生。从这两个项目的对比来看，如果一名学生的数理背景很强，但是金融业务知识和操作经验不足，更适合申请圣路易斯华盛顿大学的数理金融硕士方向。
有一些大学也会根据其金融硕士的特点直接命名，如罗格斯大学开设的是数量金融硕士， 佩斯大学开设的是金融管理硕士。
在选择学校时，学生要仔细阅读其金融硕士项目的介绍、课程设置及该项目毕业生的职业去向，这样才能更好地决定自己是否适合该项目，而不只是单纯地根据项目的名称和排名选择。
除此之外，美国高校的金融硕士项目非常注重学生的实际应用能力。学生在选择学校的时候，学校的地理位置及与周围金融机构的良好关系也是要考虑的重要因素。